另外一個重要的問題就是云之間的互操作性。根據歐洲網絡和信息安全機構（ENISA）2009年一份題為《云計算：利益、風險和信息安全建議》的文件，目前在保障數據和服務可移植性方面可提供的工具、流程、標準數據格式或服務接口幾乎wq是空白。這就使得使用不同云服務商時很難互通，因此迫使許多企業為了確保其數據能夠在云中移植而將自己“鎖死”在單個廠商身上。此外，IDC的研究也提供了進一步的補充，研究結果表明有80%的企業表示，缺乏互操作性標準是采用云計算服務過程中的一項巨大挑戰。企業要想實現可移植性的{zd0}化，方法之一就是使用支持標準編程語言、運行時環境，以及Deltacloud等標準API。 　　第三項主要的挑戰便是性能水平，而根據《2010亞太（不包括日本）云服務和技術最終用戶調查》，這一問題正是阻礙該地區云發展的一項關鍵問題。從傳統上來說，性能要求很容易滿足，因為IT部門可以對應用運行的物理和軟件環境施加某種程度的控制。但在公共云中，這意味著企業只能依靠云服務商，而且只有云服務商才能對環境施加控制。然而，在多租戶基礎設施上，這些服務商也很難像控制企業內部運行的應用那樣提供相同水平的性能保障。當有大量的數據在互聯網中穿行時，想做到這一點尤其困難。